Indhold
- Sådan fungerer buffere
- Krav til en buffer
- Valg af en passende buffer
- Sådan ændres en buffers pH-værdi
- Eksempler på biologiske buffere
I celler og levende organismer holdes væskerne, der omgiver og inde i cellerne, ved en konstant pH. PH i dette system er ofte afgørende for de biokemiske reaktioner, der forekommer i organismen. For at studere biologiske processer i laboratoriet bruger forskere buffere til at opretholde den korrekte pH-værdi under eksperimentet. Mange biologiske buffere blev oprindeligt beskrevet af Good og kolleger i 1966 og bruges stadig i laboratorier i dag.
Sådan fungerer buffere
En puffer er simpelthen en opløsning, der indeholder en svag syre og dens konjugatbase. Når der tilsættes en syre til pufferen, reagerer den med konjugatbasen, hvilket giver en svag syre og påvirker næppe opløsningens pH.
Krav til en buffer
En række egenskaber gør en biologisk buffer effektiv. De skal være opløselige i vand, men ikke opløselige eller minimalt opløselige i organiske opløsningsmidler. Bufferen skal ikke være i stand til at passere gennem cellemembranen, da dette kan påvirke celleopførsel. Buffere skal være ikke-toksiske, skal ikke absorbere UV-stråling og skal forblive inerte og stabile under hele eksperimentprocessen. Temperatur og ionisk sammensætning bør ikke ændre pH eller bufferkapacitet.
Valg af en passende buffer
Den valgte buffer skal have en pKa i det optimale interval for den undersøgte proces. En buffer med en højere pKa er passende, hvis der sandsynligvis vil være en stigning i pH-værdien under eksperimentet, og vice versa, hvis pH-værdien forventes at falde. Bufferkoncentrationer bør optimeres, da koncentrationer højere end 25 mM kan have bedre bufferkapacitet, men kan hæmme cellulære aktiviteter såsom enzymer. Metoden dikterer også hvilken buffer, der skal bruges; for eksempel ved elektroforese er en buffer med lav ionstyrke passende til at forhindre gelmatrixen i at opvarmes.
Sådan ændres en buffers pH-værdi
Fordi pH kan ændre sig med temperaturændringer, skal forskere teste bufferenes pH-værdi ved den temperatur, hvor de vil gennemføre eksperimentet. Tris er en buffer, der især er modtagelig for ændring i pH med temperatur. Alle pH-målere skal kalibreres ved arbejdstemperatur. Tilsætningsstoffer kan også ændre pH, hvilket gør genprøvning nødvendig. For at ændre pH-værdien tilsættes en syre, sædvanligvis saltsyre eller base, normalt natrium- eller kaliumhydroxid; dette skal gøres langsomt for at forhindre inaktivering eller kemiske ændringer i bufferen.
Eksempler på biologiske buffere
TE-buffer, som er 10 mM Tris · HCI og 1 mM EDTA, er passende ved et antal pH-værdier til opbevaring af nukleinsyrer. Elektroforese er en almindelig metode til undersøgelse af proteiner eller nukleinsyrer; denne proces bruger et antal buffere, herunder Tris-acetat-EDTA, Tris-glycin og Tris-borate-EDTA-buffere. Disse buffere forhindrer opvarmning af gelmatrixen og kan indeholde additiver, såsom urinstof og SDS, afhængigt af undersøgelsen.