Indhold
Bakterier spiser organisk stof og andre forbindelser og genanvender dem til stoffer, der kan bruges af andre organismer. Bakterier kan leve overalt, der har vand. De er flere, kan reproducere hurtigere og kan overleve hårdere forhold end nogen anden organisme på Jorden. Deres enorme biomasse, alsidighed og evne til at genanvende de kemiske elementer gør dem til en vigtig komponent i økosystemer. Dette gælder især i ekstreme miljøer, hvor bakterier udfører arbejde, der normalt udføres af en række organismer.
Bakteriel fordøjelse
Kemoheterotrofe bakterier kilder kulstof og energi, som de har brug for for at overleve fra organisk stof. Disse bakterier er dekomponere, der fordøjer deres mad ved at frigive enzymer i miljøet omkring dem. Enzymerne nedbryder organisk stof i enkle forbindelser, såsom glucose og aminosyrer, som kan absorberes af bakterierne. Da fordøjelsen finder sted uden for bakteriecellen, kaldes den ekstracellulær fordøjelse. Andre bakterier, kaldet kemoautotrofer, henter deres energi fra uorganiske kemikalier og deres kulstof fra kuldioxid eller en beslægtet forbindelse. Photoautotrophs får energi fra lys. Disse bakterier nedbrydes ikke organisk stof, men er vigtige for næringsstofcykling.
Cykling af kulstof og næringsstoffer
Bakterier er en nøglekomponent i carbon- og nitrogencyklusserne. Ligesom planter tager fotoautotrofer og kemoautotrofer kuldioxid fra luften og omdanner det til cellulært kulstof. Dette betyder, at kulstof bliver fikseret eller sekvesteret i bakterier. Chemoheterotrophs spiller en modsat rolle i kulstofcyklussen og frigiver kuldioxid i miljøet, når de nedbrydes organisk stof. Nitrogenfikserende bakterier, såsom cyanobakterier, indarbejder nitrogen fra miljøet i aminosyrer og andet cellulært materiale. Nogle kvælstoffixere danner symbiotiske forhold til planter, giver dem kvælstof og modtager kulstof til gengæld. Chemoheterotrofer spiller en vigtig rolle i nitrogencyklus, fordi ekstracellulær fordøjelse af organisk materiale frigiver opløseligt nitrogen i miljøet, hvor det kan optages af planter og kvælstoffikserende bakterier.
Biofilm
Mikrober er bedre rustet til at nedbryde hårde plantestoffer end andre typer af dekomponere. Bakterier danner kolonier, kendt som biofilmer, med andre bakteriearter, svampe og alger. At leve i en biofilm giver beskyttelse og giver mulighed for deling af næringsstoffer og genetisk materiale. Biofilmer starter nedbrydningsprocessen i mange økosystemer. I vandløb og søer kan mange hvirvelløse hvirvelløse ferskvand ikke bruge blade, før de er blevet "konditioneret" af biofilm. Mikrobiel konditionering blødgør blade ved at nedbryde komplekse kemiske forbindelser, såsom lignin og cellulose. Dette gør det lettere for hvirvelløse dyr at fordøje. Biofilm leverer den samme type service i terrestriske økosystemer.
Anaerobe forhold
De fleste organismer har brug for ilt for at overleve, men ilt er ikke altid tilgængeligt i miljøet. Miljøer, der mangler ilt, er kendt som anaerobe. Miljøer, der kan være anaerobe inkluderer havbunden, bladstrøbelaget på skovbund og jord. Anaerobe miljøer kan forårsages, når ilt ikke kan bevæge sig gennem materiale, for eksempel i tætpakket jord, eller når mikrober bruger ilt hurtigere, end det kan udskiftes. Heldigvis kan nedbrydning og næringsstofcykling fortsætte i fravær af ilt. Mange mikrober er i stand til at bytte ilt for andre stoffer, såsom nitrat og sulfationer. Nogle grupper som methanogenerne, der producerer methan, tåler overhovedet ikke ilt.