Indhold
Et plasmid er et lille cirkulært stykke DNA, der findes i bakterier. Plasmider er blevet nyttige værktøjer inden for bioteknologi, hvilket gør det muligt for forskere at kombinere DNA fra forskellige organismer til et kontinuerligt stykke DNA. Plasmider replikerer af sig selv under celledeling og er stabile over lange perioder, hvilket betyder at de er et fantastisk middel til opbevaring af individuelle gener som bøger i et bibliotek. Plasmider kan indeholde følgende typer gener: antibiotikaresistensgener, transgener og reportergener. Disse typer plasmidgener kan forekomme naturligt eller være konstrueret af forskere.
Antibiotikaresistensgener
Plasmider er en af årsagerne til, at bakterier bliver resistente over for antibiotika. Plasmider indeholder antibiotiske resistensgener, der producerer proteiner, der beskytter bakterierne mod skadelige lægemidler. Antibiotiske resistensgener kan arbejde på flere måder. Den ene er ved at pumpe antibiotikumet ud af bakterierne, så antibiotikumet ikke kan binde sit målprotein i cellen. Et andet er ved at nedbryde antibiotikumet i små stykker. Og et andet er ved at kemisk ændre antibiotikumet, så det ikke længere interagerer med sit målprotein. Antibiotiske resistensgener omtales også som selekterbare markører i plasmider, da de muliggør, at der kan vælges bakterier, der har resistens i et reagensglas efter behandling med et antibiotikum.
transgener
I bioteknologi bruges plasmider i vid udstrækning til at isolere et gen fra et dyr eller en plante og derefter placere det i bakterier, hvilket gør det lettere at modificere og studere dette gen. Et segment af DNA, der er skåret enzymatisk fra en organisme og placeret i et bakterieplasmid kaldes et transgen. Kombinationen af transgenet og plasmidet kaldes rekombinant DNA, da det er DNA fra to forskellige arter, der er smeltet sammen.
Reportergener
Bakterier kan undertiden sparke et plasmid ud, så forskere, der bruger plasmider til at fremstille rekombinant DNA, ofte ønsker at inkludere et gen, der giver dem mulighed for visuelt at identificere, hvilken bakteriekoloni der har bakterier, der indeholder dette plasmid. For let at visualisere positive kolonier - dem, der har det rekombinante DNA - inkluderer forskere reportergener i plasmidet. Et almindeligt reportergen er grønt fluorescerende protein (GFP), der lyser grønt under ultraviolet lys. Et andet almindeligt reportergen er lacZ, der koder for et enzym kaldet beta-galactosidase (beta-gal).Beta-gal bryder sukkerlactosen fra hinanden. Det bryder også et farveløst kemikalie kaldet X-gal i et sukker og et blåt molekyle. Således vil bakteriekolonier, der har beta-gal-reporter, vises blå.
F-Factor
Bakterier har måder at videregive genetisk information til hinanden på. Én bakterie kan dele dets plasmider med en anden bakterie gennem det, der kaldes konjugering. Konjugation er dannelsen af et tyndt rør - kaldet sex pilus - der forbinder en bakterie til en anden. Bakterien, der udvider sexpilusen, kopierer derefter et plasmid og fører kopien gennem røret ind i den anden bakterie. Det plasmid, der muliggør konjugering, kaldes F-faktor eller fertilitetsfaktor. Rekombinant DNA kan indsættes i F-faktoren, der skifter det fremmede DNA mellem bakterier.