Indhold
- Fordel: Følsomhed
- Fordel: Specificitet
- Ulempe: tilbøjelig til falske eller subjektive resultater
- Ulempe: høje omkostninger og teknisk efterspørgsel
Western blot, en analytisk teknik anvendt til at lokalisere et specifikt protein i en given prøve, anvender evnen af et enzym eller fluorescensmærket primært antistof til at binde til dets specifikke antigen. Det er en tretrinsproces, der begynder med gelelektroforese, efterfulgt af membranblotting og sondering med antistoffer. Proteindetektion kan være direkte eller indirekte, hvor sidstnævnte bruger et mærket sekundært antistof rettet mod det primære. Selvom det er accepteret som en rutinemæssig proteinanalyseteknik, har western blot begrænsninger såvel som fordele.
Fordel: Følsomhed
Et af de største argumenter til fordel for western blot er dens følsomhed. På grund af dets evne til at detektere så lidt som 0,1 nanogram protein i en prøve, kan teknikken teoretisk tjene som et effektivt tidligt diagnostisk værktøj, hvor man til og med registrerer den mindste immunogene respons fra en virus eller bakterier i en patientprøve. En indirekte westernblot bygger yderligere på denne følsomhed fra det sekundære antistofs evne til at forstærke intensiteten af det signal, der detekteres af billeddannelsessystemet. Større følsomhed betyder, at færre antistoffer er nødvendige for testning, hvilket reducerer laboratorieomkostningerne markant.
Fordel: Specificitet
Western blot-teknikken skylder sin specificitet til to store medvirkende faktorer. Først sorterer gelelektroforese en prøve i proteiner af forskellig størrelse, ladning og konformation. Denne proces er i sig selv et stort skridt hen imod påvisning, da bånd dannet i gelen allerede giver ledetråde omkring størrelsen på proteinet eller polypeptidet af interesse. Specificiteten af antistof-antigeninteraktion fungerer som den anden store faktor. Da specifikke antistoffer viser affinitet for specifikke proteiner, kan processen selektivt detektere et målprotein selv i en blanding af 300.000 forskellige proteiner.
Ulempe: tilbøjelig til falske eller subjektive resultater
På trods af dens følsomhed og specificitet kan en western blot stadig give fejlagtige resultater. Et falsk-positivt resultat, når et antistof reagerer med et ikke-tilsigtet protein, hvilket ofte sker, når en patient, der testes for HIV, tilfældigvis har tuberkulose eller et antal parasitære infektioner. En falsk-negativ kan på den anden side let resultere, hvis større proteiner ikke får tilstrækkelig tid til at overføre korrekt til membranen. Forkert blotting og bearbejdning producerer ofte skæve, falmede eller endda flere bånd, hvilket gør testresultaterne underlagt fortolkningen af teknikeren.
Ulempe: høje omkostninger og teknisk efterspørgsel
Prisen for en western blot er en sammensætning af de store individuelle udgifter til mærkede antistoffer, dygtige analytikere og laboratorieudstyr. En delikat proces, vestlig blotting, kræver præcision i hvert trin for korrekt identifikation af en prøves bestanddele. En mindre fejl i reagenskoncentration eller i inkubationsperiode kan være katastrofalt for hele processen. Endelig kan det udstyr, der kræves til detektion og billeddannelse - kemiluminescerende, fluorescerende, radioaktive eller laserdetektionssystemer - være for dyrt for den gennemsnitlige mikrobiologiske enhed.