Indhold
- Sådan bestemmes aminosyresekvensen
- Valg af aminosyrer
- Forskellige muligheder for proteiner
- Forskellen i et protein
- Hvorfor ordren er vigtig
Proteiner er blandt de vigtigste kemikalier for alt liv på planeten. Strukturen af proteiner kan variere meget. Hvert protein består imidlertid af mange af de 20 forskellige aminosyrer. I lighed med bogstaverne i alfabetet spiller rækkefølgen af aminosyrerne i et protein en vigtig rolle i, hvordan den endelige struktur fungerer. Proteiner kan være hundreder af aminosyrer lange, så mulighederne er næsten uendelige, som vi vil undersøge inden for.
Sådan bestemmes aminosyresekvensen
Du har muligvis en generel idé om, at DNA er det genetiske grundlag for alt hvad du er. Hvad du muligvis ikke er klar over, er, at den eneste funktion af DNA er i sidste ende at bestemme rækkefølgen af aminosyrer, der går ind i alle proteiner, der gør dig til, hvem du er. DNA er simpelthen lange dele af fire nukleotider, der gentager sig igen og igen. Disse fire nukleotider er adenin, thymin, guanin og cytosin og er normalt repræsenteret med bogstaverne ATGC. Uanset hvor længe dit DNA er, "læser" din krop disse nukleotider i grupper på tre og hver tredje nukleotider koder for en specifik aminosyre. Så en sekvens på 300 nukleotider ville i sidste ende kode for et 100 aminosyrer langt protein.
Valg af aminosyrer
I sidste ende skyder dit DNA mindre kopier af sig selv, kendt som messenger RNA eller mRNA, der går til ribosomer i dine celler, hvor proteiner fremstilles. RNA bruger det samme adenin, guanin og cytosin som DNA, men bruger et kemikalie kaldet uracil i stedet for thymin. Hvis du spiller med bogstaverne A, U, G og C og omarrangerer dem i grupper på tre, finder du ud af, at der er 64 mulige kombinationer med forskellig rækkefølge. Hver gruppe på tre er kendt som et kodon. Forskere har udviklet et diagram, der giver dig mulighed for at se, hvilken aminosyre et specifikt kodon koder for. Din krop ved, at hvis mRNA læser "CCU", skal der tilsættes en aminosyre kaldet prolin på dette sted, men hvis den læser "CUC", skal aminosyren leucin tilføjes. Se referencesektionen nederst på siden for at få vist et helt kodekort.
Forskellige muligheder for proteiner
Et protein kan simpelthen være en streng af aminosyrer, men nogle komplicerede proteiner er faktisk flere tråde af aminosyrer, der er forbundet. Derudover har proteiner forskellige længder, hvoraf nogle kun er nogle få aminosyrer lange, og andre er over 100 aminosyrer lange. Derudover bruger ikke alle proteiner alle tyve aminosyrer. Et protein kan muligvis være hundrede aminosyrer langt, men kun bruge otte eller ti forskellige aminosyrer. På grund af alle disse muligheder er der bogstaveligt talt et uendeligt antal mulige permutationer, der kunne være et protein. I naturen kan der være et begrænset antal proteiner; antallet af virkelige proteiner, der findes, er imidlertid i milliarder, hvis ikke mere.
Forskellen i et protein
Alle levende organismer har DNA og bruger alle de samme 20 aminosyrer til at skabe de proteiner, der er essentielle for livet. Så det kan siges, at bakterier, planter, fluer og mennesker alle deler de samme grundlæggende byggesten i livet. Den eneste forskel mellem en flue og et menneske er rækkefølgen af DNA og derfor rækkefølgen af proteiner. Selv inden for mennesker varierer proteiner drastisk. Protein udgør vores hår og fingernegle, men det udgør også enzymerne i vores spyt. Proteiner udgør vores hjerte og også vores lever. Forskellige strukturelle og funktionelle anvendelser til protein er næsten ubegrænsede.
Hvorfor ordren er vigtig
Aminosyrernes rækkefølge er lige så vigtig for proteiner som orden på bogstaver er vigtig for ord. Overvej udtrykket "Julemanden" og alt hvad der er forbundet med det. Bare omarrangering af breve kan give udtrykket "Satan", som har drastisk forskellige konnotationer. Det er ikke anderledes for aminosyrer. Hver aminosyre har en anden måde at reagere på med de andre. Nogle kan lide vand, nogle hader vand, og de forskellige aminosyrer kan interagere som poler på en magnet, hvor nogle tiltrækker og andre afviser. På et molekylært niveau kondenseres aminosyrerne til en spiralformet eller arklignende form. Hvis aminosyrerne ikke kan lide at være side om side, kan dette drastisk ændre molekylets form. I sidste ende er det formen på molekylet, der faktisk passer. Amylase, et protein i dit spyt, kan begynde at nedbryde kulhydrater i din mad, men det kan ikke berøre fedt. Pepsin, et protein i din mavejuice, kan nedbryde proteiner, men det kan ikke nedbryde kulhydrater. Aminosyrernes rækkefølge giver proteinet dens struktur, og strukturen giver proteinet sin funktion.