Indhold
Kvantificer din RNA-prøve ved at måle dens absorbans af ultraviolet lys (UV). Et nano-drop spektrofotometer bruger kun en eller to mikroliter af din prøve, som du kan gendanne. Andre spektrofotometre kræver en meget større prøve. Ekstinktionskoefficienten for nukleotider ved en UV-bølgelængde på 260 nm i en 1 cm lys bane er 20. Baseret på denne ekstinktionskoefficient er absorbansen af 40 ug / ml RNA under de samme betingelser én. Ved hjælp af disse oplysninger kan du beregne koncentrationen af din RNA-prøve.
Lav om nødvendigt en fortynding af din prøve. En standardfortynding til en mikrokuvette er 1:40. Foretag denne fortynding ved at tilsætte 2 uL RNA-prøve til 78 uL sterilt vand.
Følg protokollerne for dit specielle spektrofotometer for at kalibrere maskinen ved hjælp af et tomt og bestem derefter den optiske densitet for din prøve ved en UV-bølgelængde på 260 nm.
Multiplicer absorbans af din prøve med din fortyndingsfaktor med 40μg RNA / ml. Ligningen ville være: “RNA-koncentration (µg / ml) = (OD260) x (fortyndingsfaktor) x (40 µg RNA / ml) / (1 OD260 enhed)” (Hofstra.edu) For eksempel: Hvis du fortyndede din prøve med 1:40, og din absorbanslæsning var 0,08, du ville multiplicere 0,08 x 40 x 40 = 128 µg / ml = 0,13 µg / μL
Find ud af, om din prøve er ren ved at tage en anden absorbanslæsning ved UV-bølgelængde på 280 nm. Forholdet OD 260 / OD 280 vil indikere, om - og på hvilket niveau - din prøve er forurenet med protein eller phenol. Et resultat fra 1,8 til 2,0 indikerer RNA af kvalitet.